témavezető: Paragi Gábor
társ-témavezető: Tóth András
helyszín (magyar oldal): SZTE TTIK, Biotechnológiai T helyszín rövidítés: SZTE
A kutatási téma leírása:
Egyre ismertebbé válik, hogy a szulfid, toxicitása ellenére, az élőlények széles körében sokféle fiziológiai és patofiziológiai folyamatban vesz részt. A szulfid koncentrációjának szabályozásában, a szulfidból történő elektron felszabadításban alapvető szerepet játszó enzimek rendkívül ősi flavoproteinek. Ezek legfontosabb képviselői a szulfid kinon oxidoreduktáz (SQR) enzimek, melyeknek hat típusát különböztetjük meg. Az egyes SQR fehérje típusok hasonló alapszerkezettel rendelkeznek, azonban lényeges eltérések figyelhetők meg az enzim működése szempontjából fontos aktív centrumban. A PhD munka célja az SQR fehérjék egy eddig még részletesen nem jellemzett típusába tartozó modell fehérje szerkezeti és működési jellemzőinek vizsgálata alapvetően bioinformatikai eszközök segítségével. Az alkalmazott vizsgálati technikák között elsősorban molekulamechanikai módszerek szerepelnek (homológia modellezés, molekula dinamikai vizsgálatok), azonban szükség esetén magasabb szintű (QM/MM) számítások elvégzésére is sor kerülhet. A vizsgálatok segítségével betekintést szeretnénk nyerni a választott fehérje molekuláris szintű működésébe, valamint a működés szempontjából fontos szerkezeti elemek szerepébe.
ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): angol felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2015-10-13
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).