témavezető: Pósfai György
helyszín (magyar oldal): MTA SZBK helyszín rövidítés: SZBK
A kutatási téma leírása:
A szintetikus biológiai módszereknek köszönhetően realitássá vált akár teljes mikrobiális genomok szintézise, összeszerelése és funkcionális beindítása (transzplantációja). Ez előrevetíti a lehetőségét annak, hogy - a rendkívül gazdag mikrobiális génkészletre alapozva - tetszőleges géntartalmú és funkciójú szintetikus genomokat hozzunk létre. A jelenlegi genomikai/rendszerbiológiai analízisek úgy tekintik a bakteriális genomokat, mint a génjeik összességét. A genom azonban több ennél. A funkcionalitáshoz a rendszerszintű architektúrát is figyelembe kell venni: a genomstruktúra befolyásolja a génexpressziót, a replikációt, a genomstabilitást. Az irodalomból kevés praktikus információt nyerhetünk a genomszerkezet tervezéséhez. A genomarchitektúra kísérletes vizsgálatával olyan architekturális szabályokat akarunk feltárni, amelyek segítik a szintetikus genomok tervezését. A vizsgálatokban egyedi, csökkentett genomú E. coli törzsünk felhasználásával nagy számú izogenikus (génkészlet azonos, genomstruktúra különböző) genomkonstrukciót kívánunk összehasonlítani. A speciálisan az architekturális kérdések megválaszolásához konstruált genomok segítségével tanulmányozni kívánjuk a genomi makropozíció/replikáció, a mikrodomain méret /struktúra, valamint a globális genomi kontextus génexpresszióra gyakorolt hatásait.
ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): angol felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2014-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
