témavezető: Györfy Zsuzsanna
helyszín (magyar oldal): MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont Biokémiai Intézete helyszín rövidítés: SzBK
A kutatási téma leírása:
A genomok evolúcióját rövid, drámai expanziós ugrásokkal megszakított hosszú, dominánsan egyszerűsödéssel járó periódusok jellemzik. Ezeknek a folyamatoknak az eredőjeként, hosszú evolúciós alkalmazkodás során alakult ki a mai bakteriális genomokra jellemző 0,5-10 Mbp-os méret. Az alsó mérethatárt meghatározza az élethez minimálisan szükséges génkészlet összessége. Mi limitálja az expanziót? A DNS-szintézis megnövekedett energetikai és időbeli költsége? A genom topológiai korlátai? A makromolekulák koncentrációjának és hozzáférhetőségének valamiféle optimális meghatározottsága? A kérdés vizsgálatához gyorsított, laboratóriumi genomevolúciót kívánunk megvalósítani. Újszerű, a laboratóriumunkban kidolgozandó technikákkal, pl. hiperaktív, önterjesztő transzpozonok segítségével semleges DNS-szakaszokkal „szórjuk meg” a genomot. Megvizsgáljuk, milyen hatással van a sejt fitneszére, növekedési és fizikai paramétereire a genom méretének növelése, illetve meddig lehet eljutni a genom expandálásával. Az is vizsgálat tárgya, hogy vannak-e a genomszerveződésből fakadó korlátai az expanziónak, azaz kimutathatók-e preferált, ill. tiltott helyek a genomban.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: molekuláris biológiai labor ismeretek
Bejelentkezés
