témavezető: Pósfai György
helyszín (magyar oldal): Institute of Biochemistry, BRC helyszín rövidítés: SzBK
A kutatási téma leírása:
Evolution of genomes is characterized by long, dominant periods of reduction, punctuated by short, rapid expansions. Understanding the driving forces shaping genome complexity is of paramount importance in the era of constructing semi-synthetic microbial genomes. Testing of the hypotheses on genome reduction is hindered by the slow pace of natural evolution, and by the lack of tools speeding up genome evolution in the laboratory. Here we propose a novel scheme of random deletion generation to accelerate laboratory evolution of E. coli, and address the validity of the genome streamlining hypotheses. Applying a novel combination of traditional clone library construction and recombination/selection methods, we plan to generate a large number of random genomic deletions in a cyclic fashion in parallel cell lines, under various environmental conditions. Analysis of the strains will shed light on the genome organization principles, and will produce a blueprint for a minimal E. coli genome.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: some knowledge of mol biol techniques
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2016-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
