Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Batta Gyula
Gombaellenes fehérjék szerkezetének, dinamikájának és molekuláris kölcsönhatásainak funkcionális összehasonlító vizsgálata komplex biofizikai módszerekkel

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Debreceni Egyetem
környezettudományok
Juhász-Nagy Pál Doktori Iskola

témavezető: Batta Gyula
helyszín: Kémia épület, mélyföldszint, alsó földszint, E-18 (dolgozó szoba)
helyszín rövidítés: KÉMIA


A kutatási téma leírása:

Négy (AFP, NFAP, NFAP2, PAFB,) béta-redős szerkezetű (50-60 aminosav) homológ, ámde eltérő hatásmechanizmusú antifungális fehérje (AFP) atomi felbontású térszerkezetének meghatározása és összehasonlító vizsgálata van folyamatban. Fehérje laboratóriumunkban jó hozammal állítunk elő NMR vizsgálatokra alkalmas 13C/15N stabil izotóp jelzett natív fehérjéket és azok variánsait a Penicillium chrysogenum PAF génkiütött mutánsával. Tapasztalataink szerint a spektrumok elemzésével, az NMR asszignálást követően a a fehérjék oldatfázisú térszerkezete meghatározható a TopSpin, CARA, CCPN és UNIO/CYANA programok segítségével. Speciális NMR módszerekkel (telítés-átvitel, STD) vizsgáljuk az Aspergillus nidulans és A. niger fonalas gombákból származó membrán-kivonatok, és az antifungális fehérjék interakcióit. NMR és ITC (mikrokalorimetria) módszerekkel tanulmányozzuk a kis-molekula membrán alkotók interakcióit az AFP-kel (foszfatidil-inozitolok, ergoszterol, kationok Ca2+, Zn2+) A fehérjék natív, „feltekeredett” állapota oldatfázisban reverzibilis egyensúlyban van a „kitekeredett” állapotokkal. Extrém hőmérsékleteken a kitekeredett populációk aránya növekszik. A folyamat atomi felbontásban követhető az NMR-CEST módszerrel és termodinamikailag is jellemezhető. A hamarosan üzembe álló nagyteljesítményű (700 MHz) NMR és kapilláris DSC műszerek eredményesen fogják segíteni kiterjedt kutatásainkat

felvehető hallgatók száma: 2

Jelentkezési határidő: 2017-04-01

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 1.2318 ( 2016. XI. 26. )