Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Dinamikai mintázatok szerepe a fehérjék evolúciójában

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Debreceni Egyetem
elméleti orvostudományok
Molekuláris sejt- és immunbiológia Doktori Iskola

témavezető: Fuxreiter Mónika
helyszín: Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar
helyszín rövidítés: DEÁOK


A kutatási téma leírása:

A fehérjék evolúcióját vizsgáló szekvenciaillesztő módszerek magas aminosavsorrendbeli hasonlósági arányt, míg a szerkezetekre épülő módszerek jól meghatározható harmadlagos struktúrát követelnek meg. A lazán pakolt régiók is gyakran funkcionálisan fontosak, azonban illesztésük mindkét módszerrel problematikus. A fehérjék szekvenciális kompozíciója összefügg a rendezettségükkel, dinamikai mintázataik (Patterns Of Dynamics; POD-k) pedig az elsődleges szekvenciából jósolhatóak. A POD-k a szerkezet alacsony felbontású leírását teszik lehetővé a lokális dinamika változásain keresztül. Elemzésük alkalmas lehet a rendezetlen régiók rokonsági kapcsolatainak elemzésére, valamint kombinálható többszörös szekvenciaillesztéssel is. Terveim között szerepel egy illesztő algoritmus kidolgozása, mely alacsony szekvenciális hasonlóságú rokon fehérjék esetén is hatékonyan kimutathatja a funkcionális kapcsolatot. Célom tehát az alacsony felbontású dinamikai mintázatok széles körű elemzése és alkalmazása szerkezeti, funkcionális és evolúciós kapcsolatok vizsgálatára.

felvehető hallgatók száma: 1

Jelentkezési határidő: 2017-01-15

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 1.2318 ( 2016. XI. 26. )