Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Horváth András
Peták István
Célzott, daganatellenes hatóanyagok prediktív molekuláris diagnosztikájához szükséges informatikai fejlesztések.

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Pázmány Péter Katolikus Egyetem
biológiai tudományok
Roska Tamás Műszaki és Természettudományi Doktori Iskola

témavezető: Peták István
társ-témavezető: Horváth András
helyszín: PPKE-ITK és KPS Molekuláris Diagnosztikai Központ (1024 Retek 34.)
helyszín rövidítés: KPS


A kutatási téma leírása:

A hallgató feladata, hogy oyan informatikai fejlesztésekben vegyen részt, amelyek segítik a jelátviteli daganatellenes terápiák hatékonyságát előrejelző molekuláris diagnosztikai módszereket. Ez magában foglalja a daganatsejtek képi felismerését amely a tumoros és nem tumoros sejtek precíz felismerését teszi lehetővé. Napjainkban a mintában a tumorarányt az NGS mutáció allél kalkulációhoz a patológus szakmai tudására, és tapasztalatára alapozva szubjektív módon, ránézésre állapítja meg, ám a százalékos érték nagyban befojásolja a végleges molekuláris profilt, így szükségszerű egy pontos, automatizált módszer fejlesztése. A molekuláris diagnosztikai vizsgálatok biológiai interpretációjához szükséges jelátviteli modellek fejlesztése, a daganatok kifejlődéséért felelőssé tehető ismert targeteket és célzott gyógyszereket összekötő publikációs evidenciák összegyűtése, és dinamikus frissítése. Későbbiekben az adatbázis kiegészítése sejtvonalakon mért IC50 értékekkel és in silico modellezéssel kalkulált evidenciákkal a legpontosabb predikció érdekében.

előírt nyelvtudás: angol
ajánlott nyelvtudás: angol
további elvárások: 
erős biológiai háttér, programozási gyakorlat

felvehető hallgatók száma: 1

Jelentkezési határidő: 2017-05-31

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 1.2318 ( 2016. XI. 26. )