Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
Gyula Batta
Gombaellenes fehérjék szerkezetének, dinamikájának és molekuláris kölcsönhatásainak funkcionális összehasonlító vizsgálata komplex biofizikai módszerekkel

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Debrecen
environmental sciences
Pál Juhász-Nagy Doctoral School of Biology and Environmental Sciences

Thesis supervisor: Gyula Batta
Location of studies: Kémia épület, mélyföldszint, alsó földszint, E-18 (dolgozó szoba)
Abbreviation of location of studies: KÉMIA


Description of the research topic:

Négy (AFP, NFAP, NFAP2, PAFB,) béta-redős szerkezetű (50-60 aminosav) homológ, ámde eltérő hatásmechanizmusú antifungális fehérje (AFP) atomi felbontású térszerkezetének meghatározása és összehasonlító vizsgálata van folyamatban. Fehérje laboratóriumunkban jó hozammal állítunk elő NMR vizsgálatokra alkalmas 13C/15N stabil izotóp jelzett natív fehérjéket és azok variánsait a Penicillium chrysogenum PAF génkiütött mutánsával. Tapasztalataink szerint a spektrumok elemzésével, az NMR asszignálást követően a a fehérjék oldatfázisú térszerkezete meghatározható a TopSpin, CARA, CCPN és UNIO/CYANA programok segítségével. Speciális NMR módszerekkel (telítés-átvitel, STD) vizsgáljuk az Aspergillus nidulans és A. niger fonalas gombákból származó membrán-kivonatok, és az antifungális fehérjék interakcióit. NMR és ITC (mikrokalorimetria) módszerekkel tanulmányozzuk a kis-molekula membrán alkotók interakcióit az AFP-kel (foszfatidil-inozitolok, ergoszterol, kationok Ca2+, Zn2+) A fehérjék natív, „feltekeredett” állapota oldatfázisban reverzibilis egyensúlyban van a „kitekeredett” állapotokkal. Extrém hőmérsékleteken a kitekeredett populációk aránya növekszik. A folyamat atomi felbontásban követhető az NMR-CEST módszerrel és termodinamikailag is jellemezhető. A hamarosan üzembe álló nagyteljesítményű (700 MHz) NMR és kapilláris DSC műszerek eredményesen fogják segíteni kiterjedt kutatásainkat

Number of students who can be accepted: 2

Deadline for application: 2017-04-01

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 1.2318 ( 2016. XI. 26. )