Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
András Horváth
István Peták
Célzott, daganatellenes hatóanyagok prediktív molekuláris diagnosztikájához szükséges informatikai fejlesztések.

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: Pázmány Péter Catholic University, Budapest
biology
Roska Tamás Doctoral School of Sciences and Technology

Thesis supervisor: István Peták
co-supervisor: András Horváth
Location of studies: PPKE-ITK és KPS Molekuláris Diagnosztikai Központ (1024 Retek 34.)
Abbreviation of location of studies: KPS


Description of the research topic:

A hallgató feladata, hogy oyan informatikai fejlesztésekben vegyen részt, amelyek segítik a jelátviteli daganatellenes terápiák hatékonyságát előrejelző molekuláris diagnosztikai módszereket. Ez magában foglalja a daganatsejtek képi felismerését amely a tumoros és nem tumoros sejtek precíz felismerését teszi lehetővé. Napjainkban a mintában a tumorarányt az NGS mutáció allél kalkulációhoz a patológus szakmai tudására, és tapasztalatára alapozva szubjektív módon, ránézésre állapítja meg, ám a százalékos érték nagyban befojásolja a végleges molekuláris profilt, így szükségszerű egy pontos, automatizált módszer fejlesztése. A molekuláris diagnosztikai vizsgálatok biológiai interpretációjához szükséges jelátviteli modellek fejlesztése, a daganatok kifejlődéséért felelőssé tehető ismert targeteket és célzott gyógyszereket összekötő publikációs evidenciák összegyűtése, és dinamikus frissítése. Későbbiekben az adatbázis kiegészítése sejtvonalakon mért IC50 értékekkel és in silico modellezéssel kalkulált evidenciákkal a legpontosabb predikció érdekében.

Required language skills: angol
Recommended language skills: angol
Further requirements: 
erős biológiai háttér, programozási gyakorlat

Number of students who can be accepted: 1

Deadline for application: 2017-05-31

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 1.2318 ( 2016. XI. 26. )